Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma8Q9CWH6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma8Q9CWH6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms