Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NubplQ9CWD8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms