Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sycp2Q9CUU3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sycp2Q9CUU3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms