Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otud1Q9CUB6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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