Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fcf1Q9CTH6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fcf1Q9CTH6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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