Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ska2Q9CR46 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ska2Q9CR46 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms