Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chchd5Q9CQP3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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