Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdm1Q9CQK3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms