Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms