Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Atp6v0e1Q9CQD8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms