Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1bQ9CQC9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms