Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQC3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms