Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc5Q9CQA1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc5Q9CQA1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms