Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms