Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Use1Q9CQ56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Use1Q9CQ56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Use1Q9CQ56 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Use1Q9CQ56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Use1Q9CQ56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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