Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4921530L21RikQ9CQ47 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms