Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NenfQ9CQ45 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NenfQ9CQ45 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms