Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg3Q9CPX6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms