Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CPS8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CPS8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CPS8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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