Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh23Q99PF4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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