Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b1Q99NB9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms