Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brms1Q99N20 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms