Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Hdac9Q99N13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdac9Q99N13 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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