Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ms4a4dQ99N05 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ms4a4dQ99N05 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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