Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SrrtQ99MR6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SrrtQ99MR6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms