Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp1b4Q99ME6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms