Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprtQ99M80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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