Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5rap3Q99LM2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms