Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rcbtb2Q99LJ7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rcbtb2Q99LJ7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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