Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nmd3Q99L48 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nmd3Q99L48 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms