Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms