Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kdelr1Q99JH8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms