Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddb2Q99J79 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ddb2Q99J79 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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