Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apobec3Q99J72 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms