Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms