Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smim11aQ99J19 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Smim11aQ99J19 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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