Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf112Q96DY5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf112Q96DY5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms