Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Cldn16Q925N4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn16Q925N4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms