Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lmo1Q924W9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lmo1Q924W9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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