Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim7Q923T7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim7Q923T7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms