Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csmd1Q923L3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms