Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clip1Q922J3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clip1Q922J3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms