Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb6Q922F4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms