Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pde6cQ91ZQ1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Pde6cQ91ZQ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Pde6cQ91ZQ1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pde6cQ91ZQ1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pde6cQ91ZQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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