Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms