Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usb1Q91W78 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms