Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csde1Q91W50 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms