Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uhrf1Q8VDF2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms