Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fyco1Q8VDC1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms