Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med17Q8VCD5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms